Los inicios del Club Atlético de Madrid B se remontan a la década de los sesenta. Los rojiblancos, convertidos tras la Guerra Civil en uno de los grandes del fútbol español, buscaban acuerdos con otros clubes madrileños de inferior categoría para formar jugadores y abaratar costos. De esta manera el club mantuvo acuerdos con la A.D. Rayo Vallecano y el Getafe.
En aquellos mismos años, la empresa madrileña de radios y televisores Reyfra decide crear su propio equipo de fútbol en 1965